A disbiose pode causar diarreia através da diminuição das bactérias responsáveis pela metabolização dos hidratos de carbono não digeríveis, dificultando a fermentação dos mesmos e, consequentemente, provocar um aumento de água no intestino. Por outro lado, a diarreia poderá também estar na origem da colonização/proliferação de bactérias patogénicas causadoras de diarreia.
